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揭示病毒的起源之謎

2017-4-19  

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病毒是一個(gè)的例子。病毒沒有細(xì)胞結(jié)構(gòu),因此無法被歸類為三種生命域中的任何一種——細(xì)菌,古生菌 (另一種形式的微生物) 及真核生物(動(dòng)植物、真菌及原生生物)。某些科學(xué)家爭論道病毒并不算是活的生物體,更像是遺傳材料,無法自我增殖,必須劫持宿主細(xì)胞。其他人則認(rèn)為病毒是從細(xì)胞生物進(jìn)化而來,可以算是第四種生命域。

十年前,研究者發(fā)現(xiàn)了巨型病毒,與細(xì)胞生命形式極其相似,大大推進(jìn)了第二種理論。但一項(xiàng)發(fā)表在科學(xué)雜志上的新研究對這些巨型病毒的基因組進(jìn)行了研究,并對這一理論提出了質(zhì)疑。所以科學(xué)家是不是要從頭做起,重新尋找病毒的起源呢?

 

病毒是極其微小、構(gòu)造簡單的生物,與細(xì)胞生物并不相同。它們通常由遺傳物質(zhì)組成(DNA 或者 RNA),并在外表有一層名為衣殼的蛋白質(zhì)外殼,有的還附加一層從宿主細(xì)胞借來的殼。病毒能黑入細(xì)胞的新陳代謝,并且也只有這樣才能實(shí)現(xiàn)自我增殖,每種生命域的生物都會(huì)被不同的病毒所感染。

由于病毒嚴(yán)重依賴于宿主細(xì)胞,對是否將其定義為生命也存在爭議,有人認(rèn)為它們是活的,有人卻并不這么認(rèn)為。毫無疑問大部分僵尸臟比故事中都病毒的存在?;蛟S可以更簡單的認(rèn)為它們是不死一族(不死人?)。zui大的問題是:他們從哪里來?

很多理論爭相解釋病毒的進(jìn)化方式。一種理論認(rèn)為病毒是一種遠(yuǎn)古細(xì)胞生物的后裔,這種細(xì)胞生物寄居在其他細(xì)胞內(nèi),隨時(shí)間推移簡化了自身的結(jié)構(gòu)。這將會(huì)使它們成為*一種第四生命域的生物。如果病毒是從活的生命體中進(jìn)化而來,那么認(rèn)為它們是活的也是合理的了。

流訪客

另一種理論則認(rèn)為病毒一開始就是流遺傳顧客,是逃離了細(xì)胞監(jiān)禁的流浪基因組片段。它們可能與跳躍基因有關(guān),能夠?qū)⒆约簭幕蚪M中復(fù)制或者剪切下來,然后粘到 DNA 的其他部分上。這種情況下,病毒可能是偶然穩(wěn)定進(jìn)化的分子事故的結(jié)果。這就意味著它們從來就不是完整的活的生命體,就像計(jì)算機(jī)病毒并不是完整的計(jì)算機(jī)那樣。

兩種說法都有其缺陷。*種無法解釋簡單的病毒的來源。世界上不存在其他已知的生命體有這么簡單的構(gòu)造。另一方面,第二種理論無法解釋為什么病毒比其他移動(dòng)遺傳因子復(fù)雜這么多。

 

 

這些額外的遺傳物質(zhì)包括了合成蛋白質(zhì)的指令,這在其他病毒中十分罕見,而在一般生命形式中倒是尋常。不過它的分子系統(tǒng)尚不完整,仍然需要入侵其他細(xì)胞進(jìn)行增殖。但某些研究者認(rèn)為這些基因也可能是過去某種分子的物,可以追溯到第四種生命域的存在。

另一方面,病毒跳躍的基因使得它們傾向于從其他生命體中奪取基因。基于這個(gè)事實(shí),其他研究者又爭論說這些額外的基因可能是不斷偷竊的成果。

巨大的問題

現(xiàn)在一項(xiàng)新研究確證了病毒中所有基因本質(zhì)上都是“借”來的。該研究利用了名為下一代測序的先進(jìn)的方法,創(chuàng)建了奧地利克洛斯特新堡污水處理廠中提取的 DNA 地圖。在過去幾年里,基于下一代測序的研究已經(jīng)揭示了大量新的生命形式,并在此研究中揭露了巨型病毒 Klosneuviruses 的新血統(tǒng)。

在所有的巨型病毒中,Klosneuviruses 擁有zui齊全的合成蛋白質(zhì)基因組。通過比較不同巨型病毒的基因組,仔細(xì)重構(gòu)它們的進(jìn)化歷程,研究者有力證實(shí)了這些巨型病毒內(nèi)的蛋白質(zhì)合成機(jī)器是相對近期的基因添加物——并非更大的先祖基因組的物。

該研究認(rèn)為這些病毒試圖劫持的宿主細(xì)胞可能已經(jīng)進(jìn)化出了相應(yīng)的防御策略,即將蛋白質(zhì)隱藏起來不讓入侵者看到。于是這些病毒只好把某些基因片段集成到自己的基因組中。研究者總結(jié)道該研究中分析的巨型病毒起源于更小的病毒,已經(jīng)經(jīng)過了多次進(jìn)化,因此不可能從細(xì)胞生命進(jìn)化而來。

 

 

巨型病毒從其他生命體中奪取 DNA,變得越來越大

然而,并不能僅根據(jù)新的證據(jù)就*鑒定病毒的血統(tǒng)。我們每天都能發(fā)現(xiàn)生命樹上新的分節(jié),新的發(fā)現(xiàn)可能仍能顯示細(xì)胞生命和非細(xì)胞生命之間的關(guān)聯(lián)——或者沒有關(guān)系。在此之前,我們會(huì)一直思考生命的本質(zhì),臟比和病毒之間的,以及詢問“這特么到底是啥?”

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