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新生突變（de novo mutations，DNMs）是指父母的生殖細(xì)胞在減數(shù)分裂過(guò)程中發(fā)生并遺傳給下一代的突變，在多種散發(fā)性疾病，尤其是散發(fā)性神經(jīng)精神疾病中扮演著重要的角色?；诤诵募蚁档娜怙@子測(cè)序（whole-exome sequencing， WES）和全基因組測(cè)序（whole-genome sequencing， WGS）已經(jīng)成為鑒定DNMszui直接有效的方法。
近日，中國(guó)科學(xué)院北京生命科學(xué)研究院吳金雨等課題組通過(guò)分析4種神經(jīng)精神疾?。?/span>autism spectrum disorder，ASD；epileptic encephalopathy，EE；inlectual disability，ID；schizophrenia，SCZ），共計(jì)3,555個(gè)核心家系的17,104個(gè)新生突變，研究發(fā)現(xiàn)：1）神經(jīng)精神疾病患者比正常對(duì)照個(gè)體具有更高的突變速率 (P < 1.3E-7)，發(fā)現(xiàn)升高的突變速率主要是由無(wú)義突變、有害的錯(cuò)義突變和移碼突變?cè)斐傻?，說(shuō)明這些有害突變對(duì)神經(jīng)精神疾病的發(fā)生具有重要影響；2）基于這些有害突變，總共鑒定了764個(gè)神經(jīng)精神疾病致病基因。在這些候選基因中，不但包括已知的致病基因，例如CHD8, SCN2A, RLEN, NRXN1 等，還包括多個(gè)新的候選基因，例如SUV420H1，SLC32，KATNAL2，TAF13 等；3）同時(shí)發(fā)現(xiàn)53個(gè)候選基因存在于兩種以上疾病中，顯著高于隨機(jī)情況(P < 1E-6)，暗示這些疾病的分子通路和遺傳機(jī)制具有很大的交集；4）研究人員還利用人腦的腦皮層表達(dá)數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)四種神經(jīng)精神疾病候選基因在構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)上面也具有相似的表達(dá)模式；5）此外為方便相關(guān)科研工作者，研究人員基于上述收集的四種神經(jīng)精神疾病核心家系測(cè)序得到的新生突變數(shù)據(jù)構(gòu)建了NPdenovo數(shù)據(jù)庫(kù)（http://122.228.158.106/NPdenovo）。同時(shí)，還對(duì)這些突變進(jìn)行了詳細(xì)注釋，方便用戶挖掘相關(guān)致病基因。
圖1. NPdenovo 數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)分析流程
圖2. 四種神經(jīng)精神疾病中潛在致病基因的鑒定以及重合情況
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