齊一生物科技（上海）有限公司
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8月3日，學(xué)術(shù)期刊Nucleic Acids Research 在線發(fā)表了中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所惠靜毅研究組題為Genome-wide analysis of YB-1-RNA interactions reveals a novel role of YB-1 in miRNA processing in glioblastoma multiforme 的研究成果。該研究揭示了mRNA主要包裝蛋白YB-1能夠通過識別miRNA末端環(huán)，阻礙miRNA加工機(jī)器Microprocessor和Dicer對miRNA底物的結(jié)合，從而調(diào)控了miRNA的生物合成，并由此影響多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞生長的新功能和新機(jī)制。
YB-1蛋白是人mRNA包裝蛋白的主要成員之一，參與編碼基因表達(dá)中mRNA轉(zhuǎn)錄、剪接、翻譯等多個過程的調(diào)控。近年來，由于YB-1蛋白在多個腫瘤中高表達(dá)，并能促進(jìn)腫瘤發(fā)展，所以YB-1被認(rèn)為是潛在的腫瘤治療靶點。但是，YB-1在細(xì)胞內(nèi)的RNA結(jié)合位點、轉(zhuǎn)錄后水平的關(guān)鍵靶標(biāo)以及調(diào)控機(jī)制并不清楚。
在該研究中，博士研究生吳帥來等人在研究員惠靜毅的指導(dǎo)下運(yùn)用紫外交聯(lián)-免疫沉淀與高通量測序相結(jié)合的技術(shù)在全基因組范圍內(nèi)確定了YB-1蛋白的RNA結(jié)合位點和結(jié)合基序。不僅發(fā)現(xiàn)它可以結(jié)合在大多數(shù)編碼基因的mRNA和pre-mRNA上，也發(fā)現(xiàn)它可以結(jié)合于miRNA末端環(huán)中，并且YB-1水平的改變會導(dǎo)致一系列miRNA的表達(dá)發(fā)生變化。通過對YB-1調(diào)控miR-29b-2的機(jī)制研究，發(fā)現(xiàn)YB-1能夠特異性地識別miR-29b-2的末端環(huán)序列，并導(dǎo)致DGCR8和Dicer無法識別pri-miR-29b-2和pre-miR-29b-2，進(jìn)而抑制了miR-29b的生物合成。進(jìn)一步的研究結(jié)果顯示，YB-1在多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中的高表達(dá)與miR-29b的表達(dá)成負(fù)相關(guān)性，YB-1能夠通過抑制miR-29b表達(dá)促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖。審稿人一致認(rèn)為該項工作通過令人信服的生化數(shù)據(jù)闡明了RNA結(jié)合蛋白通過結(jié)合miRNA末端環(huán)抑制miRNA加工的分子機(jī)制，并豐富了人們對miRNA加工調(diào)控的生物學(xué)功能的認(rèn)識。
該項目的完成得到上海第二軍醫(yī)大學(xué)附屬長征醫(yī)院和廣州中山大學(xué)附屬孫逸仙紀(jì)念醫(yī)院神經(jīng)科的幫助，并獲得國家科技部、國家自然科學(xué)基金委、中國科學(xué)院的經(jīng)費(fèi)支持。
YB-1通過結(jié)合miRNA末端環(huán)調(diào)控miRNA加工的機(jī)制與功能
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