一、疏水層析是利用蛋白質(zhì)在高鹽條件下吸附在疏水層析介質(zhì)的疏水基團上，降低鹽濃度時，不同蛋白按疏水性從弱到強依次被洗脫，從而達到分離純化的目的。
二、與親和層析、離子交換層析相比，疏水層析在分離過程中，分離介質(zhì)與蛋白質(zhì)分子之間的相互作用力較弱，蛋白質(zhì)在層析分離中不易發(fā)生分子結(jié)構(gòu)的激烈改變，不易喪失活性，因此其應用領域不斷擴大，分離介質(zhì)的種類也日益增多。
三、方式：
(1)pH的篩選，可以提高產(chǎn)物收率，pH值升高會減弱疏水作用，一般選擇維持生物大分子的生物活性的中性條件(pH6~8)。
(2)疏水吸附作用隨著溫度的上升而增強，樣品和純化系統(tǒng)的溫度需保持一致，溫度對疏水層析的影響非常大。
(3)一般為低鹽洗脫，或者需要更強的洗脫條件，可加入少量的有機溶劑或去垢劑。
四、疏水層析也稱疏水作用層析(hydrophobicinteractionchromatographyHIC)。蛋白質(zhì)表面一般有疏水與親水基團，疏水層析是利用蛋白質(zhì)表面某一部分具有疏水性，與帶有疏水性的載體在高鹽濃度時結(jié)合。在洗脫時，將鹽濃度逐漸降低，因其疏水性不同而逐個地先后被洗脫而純化，可用于分離其它方法不易純化的蛋白質(zhì)。
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