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DNA由A、G、C、T四個核苷構(gòu)成?？茖W家在DNA序列中經(jīng)常發(fā)現(xiàn)許多替代這四個正常字母的變體，它們通常能夠幫助細胞控制基因開關(guān)，被稱為“表觀遺傳標記”。以往科學家只能在偶然情況下發(fā)現(xiàn)這些變體。而據(jù)美國麻省理工學院（MIT）近日消息稱，該校和佛羅里達大學及其他機構(gòu)研究人員開發(fā)出一套先進的技術(shù)平臺，能有系統(tǒng)地發(fā)現(xiàn)未知的表觀遺傳標記和變體。
DNA變體通常是在細胞分裂過程中合成DNA時由酶插入其中的，一般作為標記“告訴”細胞何時該把哪些基因打開、哪些關(guān)閉。此外，變體還能幫細胞保護自身DNA免受外來細菌、病毒DNA的攻擊。這類變體大都能幫助所有的RNA，包括信使RNA和轉(zhuǎn)運RNA，實現(xiàn)它們的功能。
MIT生物工程學院的皮特·戴頓教授說：“我們開發(fā)出一個技術(shù)平臺，可用于發(fā)現(xiàn)新變體并描述它們的特征。”這個平臺把單分子實時測序的觀察能力、比較基因組學的預(yù)測能力和生物分析學的探測與識別能力結(jié)合在一起，讓研究團隊能有系統(tǒng)地尋找新變體，弄清楚變體是什么，以及它的作用。
比較基因組學通過篩選不同生物的基因組，找出特殊的DNA序列，為潛在的DNA新變體提供了zui初的線索。單分子實時測序儀器在檢測基因組時，遇到非傳統(tǒng)的四種核苷會發(fā)出信號。戴頓解釋說，檢測過程中會出現(xiàn)短暫停頓，只要恰當調(diào)整軟件就獲得信號，知道它在基因組什么地方。“這讓你能繪制出整個基因組中的DNA變體。”檢測手段不能揭示變體是什么，但能確定它的位置。
研究團隊已發(fā)現(xiàn)了一個叫做dADG的變體，是細菌防御系統(tǒng)的一部分，能保護其自身基因組不受病毒感染。研究人員認為，在細菌和病毒中可能有許多尚未發(fā)現(xiàn)的DNA變體，它們的發(fā)現(xiàn)將會為研究人員提供新的抗生素標靶和生物技術(shù)工具。
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