久久亚洲精品天码av,午夜福利屄插穴,午夜福利视频91,亚欧美爽爽爽爽爽,亚洲欧美日韩色色图片,青青操在线观看,精品天堂麻豆av,无码av东京热,婷婷成人亚洲少妇

產(chǎn)品展廳收藏該商鋪

您好 登錄 注冊(cè)

當(dāng)前位置:
上海源葉生物科技有限公司>技術(shù)文章>Cell等文章聚焦基因組測(cè)序癌癥研究

技術(shù)文章

Cell等文章聚焦基因組測(cè)序癌癥研究

發(fā)布時(shí)間:2011-10-13

近年來(lái)基因組測(cè)序技術(shù)發(fā)展迅猛,為各種疾病的研究打開(kāi)了一扇新窗口,比如癌癥研究領(lǐng)域,就在新型測(cè)序技術(shù)的基礎(chǔ)上獲得了不少重要的成果,近期Cell,Nature Genetics等*刊物也發(fā)表了這方面的成果。

A Rapid, Extensive, and Transient Transcriptional Response to Estrogen Signaling in Breast Cancer Cells
默克密理博*RNA-蛋白互作RIP試劑盒助您揭開(kāi)RNA世界的奧秘,相關(guān)資料!

來(lái)自美國(guó)康奈爾大學(xué),德州大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心等處的研究人員利用一種新型的測(cè)序技術(shù)完成了目前zui全面的雌激素主要瞬即效應(yīng)的檢測(cè),表明雌激素對(duì)乳腺癌細(xì)胞的作用是如此直接和廣泛,這對(duì)于乳腺癌的基礎(chǔ)研究及治療都具有重要的意義。這一研究成果公布在Cell雜志上。

科學(xué)家們?cè)缧┠昃鸵阎来萍に卦谌橄侔┘?xì)胞中起著重要的作用,約2/3的乳腺癌細(xì)胞都有雌激素受體表達(dá),這些受體可將雌激素作為有絲分裂信號(hào)產(chǎn)生響應(yīng)。雌激素是乳腺癌生長(zhǎng)的首要驅(qū)動(dòng)力,雌激素受體可以成為激素抑制治療藥物(如他莫西芬)的作用靶點(diǎn)以及預(yù)后判斷指標(biāo),因此這方面的研究也受到了許多大型實(shí)驗(yàn)室的關(guān)注。

在這篇文章中,研究人員利用一項(xiàng)叫GRO-seq(Global Run-On Sequencing)測(cè)序技術(shù),并通過(guò)一種新的生物信息學(xué)方法來(lái)分析數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)雌激素信號(hào)能快速,有力,并以一種出乎預(yù)料的短暫方式直接調(diào)節(jié)很大部分的轉(zhuǎn)錄譜。除編碼蛋白的基因外,雌激素還調(diào)控了全部三種RNA聚合酶的分布和活性,事實(shí)上還包含迄今為止所有描述過(guò)的每一類非編碼RNA,研究人員還發(fā)現(xiàn)數(shù)千種以往未注明或未檢測(cè)到的由雌激素調(diào)節(jié)的基因間轉(zhuǎn)錄,為進(jìn)一步研究開(kāi)辟了新的方向。這為引發(fā)細(xì)胞分裂的雌激素依賴作用提供了一個(gè)有關(guān)的更廣的基因調(diào)解譜圖。

這種GRO-seq技術(shù)可以在整個(gè)基因組范圍上繪制參與轉(zhuǎn)錄的RNA聚合酶的位置、數(shù)量和定位。通過(guò)這項(xiàng)技術(shù),研究人員可以在短時(shí)間內(nèi)對(duì)雌激素在分子水平對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)調(diào)節(jié)作用進(jìn)行觀察。在此之前,研究人員需要基于穩(wěn)態(tài)基因表達(dá)方式或需耗費(fèi)數(shù)小時(shí)或數(shù)天的靜態(tài)成像技術(shù),對(duì)根據(jù)DNA序列制備RNA拷貝的基因轉(zhuǎn)錄過(guò)程進(jìn)行干擾以便進(jìn)行觀察。現(xiàn)在,通過(guò)GRO-seq技術(shù),研究人員可以觀測(cè)到基因組水平的進(jìn)行的轉(zhuǎn)錄,這是一種對(duì)所有參與DNA聚合酶位置和定向的高分辨率虛擬圖譜。

除此之外,這項(xiàng)研究還采用了一種新型生物信息學(xué)方法來(lái)分析數(shù)據(jù),這種方法可以直接運(yùn)用GRO-seq的數(shù)據(jù)來(lái)發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄物。這樣研究人員還發(fā)現(xiàn)了許多未曾被發(fā)現(xiàn)的雌激素調(diào)控的基因間轉(zhuǎn)錄物,其中有很多與雌激素受體的結(jié)合位點(diǎn)相鄰。因此可以說(shuō)這是目前進(jìn)行的zui全面雌激素主要、瞬即效應(yīng)的測(cè)量,這為理解其他系統(tǒng)中信號(hào)依賴的快速轉(zhuǎn)錄進(jìn)行提供了資源。

Genomic sequencing of colorectal adenocarcinomas identifies a recurrent VTI1A-TCF7L2 fusion

來(lái)自美國(guó)Dana-Farber癌癥研究所(Dana-Farber Cancer Institute)、哈佛醫(yī)學(xué)院、布洛德研究所(Broad Institute)、以色列魏茲曼科學(xué)等處的研究人員對(duì)大腸癌樣品展開(kāi)了全基因組測(cè)序分析,并從中發(fā)現(xiàn)了與大腸癌發(fā)病相關(guān)的一個(gè)新的基因融合。新研究發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步進(jìn)入了解大腸癌的發(fā)病演化機(jī)制提供了新線索。

研究人員利用Illumina GAII的測(cè)序平臺(tái)對(duì)9例大腸癌腫瘤組織及匹配的正常組織進(jìn)行了全基因組測(cè)序分析,其測(cè)序深度分別達(dá)到30.7倍和31.9倍。根據(jù)基因組分析的結(jié)果,研究人員發(fā)現(xiàn)了137,968個(gè)潛在的體細(xì)胞突變,其中的712個(gè)有可能導(dǎo)致了蛋白質(zhì)編碼序列堿基錯(cuò)義替換(non-synonymous substitution)、插入或缺失。研究人員利用質(zhì)譜基因分型法對(duì)521個(gè)缺失突變進(jìn)行了檢測(cè),證實(shí)其中的439個(gè)是真正的體細(xì)胞突變。

基于基因組分析的結(jié)果,研究人員推測(cè)出每個(gè)大腸癌基因組大約每10-6個(gè)序列包含5個(gè)突變,其中基因間序列大約為每10-6個(gè)序列包含6.7個(gè)突變,內(nèi)含子序列大約為每10-6個(gè)序列包含4.8個(gè)突變,外顯子序列大約為每10-6個(gè)序列包含4.2個(gè)突變。此外,研究人員還粗略推算出在外顯子序列中大約每10-6個(gè)序列就包含3.1個(gè)錯(cuò)義突變。研究人員指出與過(guò)去的研究相一致的是,他們發(fā)現(xiàn)突變主要集中在基因組的CpG位點(diǎn)。

在隨后研究人員在對(duì)另一組的97個(gè)結(jié)腸癌腫瘤樣品進(jìn)行篩查時(shí),在3例癌癥樣本中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的基因融合VTI1A -TCF7L2。

新研究*次揭示了與大腸癌發(fā)病相關(guān)的一個(gè)基因融合,這一研究發(fā)現(xiàn)或?qū)椭t(yī)生更有效地開(kāi)展臨床治療,并推動(dòng)研究人員開(kāi)發(fā)出新治療藥物及大腸癌癌診斷新工具。

 

收藏該商鋪

請(qǐng) 登錄 后再收藏

提示

您的留言已提交成功!我們將在第一時(shí)間回復(fù)您~

對(duì)比框

產(chǎn)品對(duì)比 二維碼 意見(jiàn)反饋

掃一掃訪問(wèn)手機(jī)商鋪
在線留言
合江县| 德安县| 松原市| 双流县| 葵青区| 太和县| 辽阳市| 和顺县| 岳普湖县| 商都县| 大连市| 长泰县| 定陶县| 当阳市| 玉山县| 邳州市| 图片| 瓮安县| 龙山县| 集安市| 新泰市| 府谷县| 赤水市| 蛟河市| 普兰县| 宜州市| 五大连池市| 泸水县| 高安市| 左权县| 漳浦县| 日喀则市| 金溪县| 龙门县| 轮台县| 奉贤区| 黄梅县| 贡觉县| 女性| 梨树县| 卢湾区|